HMGCR在大腸直腸癌之角色以及lncRNA在肺癌TKI抗藥性之研究

Abstract

HMGCR (3-Hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase, HMGCR)是合成膽固醇的速率決定酵素，將 HMG-CoA轉換成mevalonate，因此膽固醇生合成路徑也稱為mevalonate pathway；活化mevalonate pathway會促進GTPase farnesylation，加速細胞之生長與癌化；臨床上，服用Statins (HMGCR 抑制劑)可減少血中膽固醇濃度，降低心血管與腦血管疾病之發生率。大腸直腸癌(Colorectal Cancer, CRC)為世界發生率第三高之癌症，其患者腫瘤組織之HMGCR活性較正常組織高，服用statins可降低罹患大腸直腸癌之風險，我們使用HMGCR表現較多的HCT116以及HMGCR表現較低的SW480來探討HMGCR在大腸直腸癌的角色。 使用shRNA knockdown或CRISPR knockout HCT116之HMGCR，會增加apoptotic marker (Cleaved caspase-3)之表現，減少pro-survival (Mcl-1)之表現；Overexpress HMGCR至SW480則增加Mcl-1之表現，與發炎相關的COX-2以及引發DNA de novo methylation的DNMT3A之表現亦增加，推論HMGCR是CRC致癌因子之一。 我們以RNA sequencing分析兩組TKI-resistant 細胞，HCC827 vs HCC827/IR和H1975 vs H1975/AR，發現參與調控cell adhesion、tight junction以及提升cell migration能力之蛋白之mRNA有差異，例如cell adhesion相關的E-cadherin與Occludin之表現量在HCC827/IR和H1975/AR較少；另外，我們分析lncRNAs表現之差異，發現兩個lncRNAs：CLU及CRNDE高度表現在HCC827/IR和H1975/AR細胞，主要分布在核內，使用DNA gapmers knockdown CLU與CRNDE，探討其在TKI-resistance的角色。