開發次世代定序技術於癌症診斷之應用

Abstract

現今癌症在臨床上面臨的最大挑戰是對於腫瘤縱向變化的過程尚有許多未瞭解之處，包含細胞如何從良性型態發展成惡性型態？腫瘤細胞轉移和產生耐藥性的機制？在目前癌症的臨床分析中，腫瘤分子核酸變異分析已逐步發展成臨床癌症分類及伴隨式診斷的依據。隨著分子生物技術的進步，次世代定序技術(NGS)在現今癌症研究中扮演著重要的角色。然而，NGS在許多癌症診斷的需求上尚未能提供滿足，而主要的瓶頸是在NGS平台的選擇及測試分析流程建立過程中最適化及標準化的臨床要求。為了增進臨床診斷的進步，我們期望利用新一代NGS 的技術，逐步開發各式癌症診斷的應用方案。在目前的研究中，我們就實體腫瘤的早期診斷和白血病檢測建立了分析流程，同時在臨床醫生的合作協助下建立了本土性的臨床資料。經過這些年的研究過程，我們分別在實體腫瘤及白血病上建立了（i）一個基於液體活檢為基礎的早期大腸直腸惡性腫瘤診斷模型，其AUC 為 0.988； （ii）一種測試算法來鑑定兒童B細胞急性淋巴細胞白血病（B-ALL）中的激酶基因融合變異，發現台灣費城染色體陰性B-ALL的發生率較歐美地區為低，同時發現了一個新的基因亞型變異。 通過這種策略及研究成果，我們希望能替台灣的癌症診斷提供本土化的參考依據。