台灣溪哥的族群遺傳研究-微隨體基因座的應用

Abstract

台灣的溪哥分為粗首?和平頷?兩種。同功異構?及粒腺體DNA的資料顯示，粗首?以高屏溪為界，分為粗首?南型及粗首?北型，平頷?依據外表形態分為平頷?日本型及平頷?台灣型。本研究利用兩種不同的選殖方法，由粗首?基因體中篩選出12個可跨種適用於平頷?的微隨體基因座，對13條溪流中405個溪哥個體作基因型判讀。以此作為分子標記，分析粗首?和平頷?的遺傳組成，顯示在篩選出的微隨體基因座上，粗首?和平頷?間有明顯的分化，而粗首?南型和北型、平頷?台灣型和日本型間，也有一定的差異。平頷?種內兩型間的差異較粗首?大，同時平頷?日本型的多型性甚高，推測平頷?日本型可能是日本的平頷?經放流而來。 粗首?不同族群間的分化程度頗高（FST值平均值為0.244）。而根據地理位置，將粗首?族群區分為北部（淡水河及蘭陽溪）、中部（後龍溪、大肚溪、樸子溪及曾文溪）、南部（枋山溪及高屏溪，即粗首?南型）和東部（秀姑巒溪、利嘉溪、知本溪及太麻?溪）四個地理區，地理區內的遺傳距離及分化程度（FST值）基本上較地理區間來得小。同時南部族群與北部族群間的差異很明顯。 利用8個微隨體基因座基因型資料進行歸類分析（assignment test），可將未知來源的粗首?或平頷?個體歸類至正確的來源族群中（正確率為97％），但無法將淡水河的個體歸類至正確的支流（正確率為81％及64％）。台灣的溪哥在流域間的分化程度很高，但在流域中不同支流間的分化程度不高。 東部河川的粗首?係經放流而來，親緣關係樹及歸類分析的結果顯示，東部族群的來源主要是北部的淡水河及中部的大肚溪。