日本鯷的微隨體基因座及系群判別

Abstract

日本鯷(Engraulis japonica)為一經濟性魚種，廣泛分佈於北太平洋西岸的溫帶至熱帶間。成魚於春季時會洄游至台灣東北海域，以及台灣海峽大部份海域。本研究即以日本鯷為對象，進行微隨體基因座的選殖工作，並以所選殖出的7個具高度多型性的微隨體基因座作為遺傳標記，針對3個不同時空的日本鯷樣本巡行系群判別。 以(AC)10、(TC)10、(CAC)5CA、CT(ATCT)6、(TGTA)6TG、CT(CCT)5等6種探針，針對2400個菌株進行雜合反膺，一共篩選出31個重複單元次數大於5的微隨體基因座其中包括三種額外的基因座，和一些複合式的基因座。其中成功設計引子者有26個。經測試後發現此26個基因座皆呈多型性，其中有7對具有高度的多型性，而且解析效果良好。 在族群狀態方面，日本鯷其3組樣本皆顯著地偏離哈溫平衡，並且有異型合子不足的現象。固定指數和遺傳距離兩個參數皆顯示宜蘭和澎湖的兩個族群的差別，在統計上並不顯著。於相關性的檢測上，對偶基因共用度MXY值的敏感度高於親緣關係度RXY值，MXY值為基礎所畫出的樹狀圖中有較高比例的宜蘭灣族群被包含於一群中。可能暗示了宜蘭灣日本鯷秋季系群的存在。而兩種微隨體基因座演化模式的套用，具現有的數據，並不能明確的指出何種模式適用於日本鯷，但是基因座EJ41.1同時棄卻兩種突燮模式(IAM,TPM)，可能是由於此基因座本身結構上的因素，不能以TPM解釋，但是不符合IAM的原因仍有待商榷。 日本鯷是否有先混群再分別徊遊至台灣東、西北海域；宜兩灣族群是否有秋季群的存在，則仍須進一步的實驗及分析。