半穴居短尾鼩的微隨體基因座及其親族關係

Abstract

本研究以半穴居的短尾鼩為對象，進行微隨體基因座選殖的工作，並利用多型性的微隨體基因座探討短尾鼩的親族關係。利用(AC)10、(TC)10、(CAC)5CA、CT(ATCT)6、(TGTA)6TG和CT(CCT)5六種探針，針對8400個菌株進行雜合反應，一共篩選出46個重複次數大於5次以上的微隨體基因座，其中有21個以AC為主、19個以TC為主、2個以CCT為主和額外篩選出4個以其他重複為主的微隨體基因座。進一步以微隨體基因座兩側的序列進行PCR引子的設計，發現其中11個基因座在短尾鼩族群中呈現高度的多型性，有些基因座的對偶基因甚至高達20個，且Ho和He的範圍分別介於0.33-0.92和0.82-0.96之間。利用這些多型性的微隨體基因座探討36隻短尾鼩的親族關係，並依分佈範圍的縮小將之區分成3個不同的族群，發現三個族群觀察的親族關係和模擬哈溫平衡下、逢機交配的族群並沒有差異，表示族群內可能無近親交配的情形，且使得族群的個體間並沒有明顯的親族關係，但代表親族關係的R值，隨著採集地點範圍縮小仍有增加的趨勢。