遺傳疾病次世代基因分析套組之建立

Abstract

背景 基因分析為遺傳疾病確認診斷的工具。毛細管電泳是基因序列分析的標準方法，雖然準確，但因為人力和時間的耗費，價格無法降低。最近由於基因醫學的快速進步，許多臨床上表現相似的遺傳疾病，已知是由多個基因引起。若使用毛細管電泳來分析，其價格依基因數目倍增，變得相當龐大。次世代基因分析用晶片的觀念，可同時分析許多的基因，甚至全基因 (whole genome) 分析都做得到。 目的 本研究擬建立遺傳疾病次世代基因分析套組，設計高達408個基因，包含肢帶肌肉失養症、Charcot Marie Tooth氏症 (CMT, 進行性神經性腓骨萎縮症)、Brugada 猝死症、努南症候群及溶小體儲積症等。可應用在多種疾病，符合臨床運用的目的。 方法 我們從受檢者血液中抽取DNA，標靶序列捕獲捕捉平台設計所含之基因的外顯子，聚焦在408個目標基因，再用生物資訊技術分析這些捕捉的序列。本研究先用四群疾病(肢帶肌肉失養症、CMT、神經肌肉疾病、成骨不全症∕Ehlers-Danlos症候群)共40名病人來測試；並且同時監測各外顯子捕捉之效率。 結果 此NGS基因分析套組的平均覆蓋率為174.9x，95.7%的核苷酸讀深超過30x。在40人中，致病性變異點可在16個人身上被偵測到 (40%)。其中，又以肌肉失養症的診斷率最高，21個肌肉失養症病人可以確認出10名患者的致病基因變化(47.6%) ，其次為CMT 33% (2/6) 和OI∕EDS 33% (3/9)。 結論 次世代定序基因套組可以快速有效的偵測患者的致病基因變化，提供患者與醫療人員得知正確的診斷以供後續照顧參考。