利用Simulink®檢測糖解作用模型之動態行為

Abstract

糖解作用(Glycolysis)是生物體的核心代謝途徑，在文獻中有不少可以提供參考的數學模型，因此是用電腦程式建模與模擬較好呈現的一個生化途徑。本論文透過Simulink®建模和其他電腦建模方法做比較，並且也對不同的糖解數學模型做比較，探討糖解模型之間的相似度與相異度，並探討是否可以用糖解模型之模擬取代生物實驗。 此篇論文重製了兩篇不同團隊提出來的糖解模型(簡化糖解模型及完整糖解模型)，加以修改、比較及討論。針對簡化過後的模型和還未簡化的模型，去比較這兩者糖解模型行為模式的差異，雖然不同的模型所探討的代謝問題不一樣，但因為探討的主要對象和生化機制相同，其存在相同的部分代謝途徑可以作為比較的重點。 本論文的架構為利用Simulink®去實現糖解作用的數學模型，針對不同的模型去做參數上面的調整，比較簡化前後的差異，另外比較及說明Simulink®這個套件的優缺點，及所適合使用的模型類型。