應用粒線體DNA分析臺灣的九孔族群關係

Abstract

九孔（Haliotis diversicolor）是台灣重要的經濟性貝類，除了西部沙岸外，沿海的岩礁海岸都有天然九孔的分佈。本實驗主要以限制內切核酸?（restriction endonucleases）處理九孔mtDNA ，分析本省九孔的族群關係。本實驗的九孔來自四個具有地理隔絕性區域（臺北縣鼻頭角，宜蘭縣頭城，花運縣磯崎，台東縣成功）的野生九孔及來自宜蘭的養殖種九孔。 從成熟母貝卵巢中抽取 mtDNA ，用五種限制內切?（BamHI, HindⅢ， KPnI , SstI , XbaI ）處理60隻九孔mtDNA 初步得到九孔mtDNA分子量大小為17.33一19.57Kb ．再由切片段經數學方法轉換成核?酸分歧度（P值， nucleotide diversity ）。發現各地區間的九孔有演化發生不連續（ phylogenetic discontinuity ）的現象，顯示九孔有因地理隔絕而造成族群間的分化（differentiation）的結果。核?酸分歧度經UPGMA一Cluster 整合後繪成演化發生系統樹（evolutionary phylogenetic trees ) ，得到宜蘭頭城地區的野生九孔族群內的 mtDHA?切型式組成（composite digestion patterns）最保守（conserved）和穩定，表示此區域的地理環境隔絕性較強。花蓮、台東地區的野生九孔有基因流動（ gene flow）的現象。而養殖種的九孔來源可能是取自宜蘭頭城的野生種。 再用十種限制內切（ BamH I , Bc1 I , Bgl II，BstE II, EcoR I , Hind III， Kpn I, Pvu II， Sst I , Xba I）處理九孔mtDNA ，得到一個有26個切片段的限制內切?切圖譜（restriction endonuclease map ）。並配合族群分析的?切片段結果，得到九孔mtDNA在核?酸序列（nucleotide sequences）上至少有五種以上的變異情形。