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http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/75138
標題: | 台灣地區烏魚粒線體DNA控制區序列變異及族群遺傳之研究 Variation of the mtDNA Control Region and Population Genetics of the Grey mullet (Mugil cephalus) in Taiwan |
作者: | Chien-Ho Liu 劉健合 |
出版年 : | 2000 |
學位: | 碩士 |
摘要: | 烏魚(Mugil cephalus L.)是台灣重要的經濟漁獲。台灣沿岸經年都有烏魚存在,而每年的冬至前後期間,亦有一群自北方洄游至台灣西南海域產卵的洄游性烏魚。本研究主要的目的在利用粒線體DNA(mtDNA)之控制區作為生化指標,藉以探討台灣沿岸與冬至洄游烏魚是否同為一個族群。本研究樣品共計烏魚43尾,其中包括新竹沿岸11尾與高雄沿岸10尾、冬至洄游必經海域(新竹外海)10尾與台灣西南海域產卵場(高雄外海)12尾。mtDNA經萃取後,利用特定的引子,以聚合?鏈鎖反應(PCR)方法,將mtDNA控制區放大並定序。其後,控制區序列以ClustalW軟體進行比對,發現台灣海域烏魚共可分為四種不同的單倍基因型。以Kimura雙參數模式(Kimura-2-parameter model)計算各基因型鹼基替代百分率,結果顯示台灣沿岸(包括新竹與高雄)的烏魚為同一族群,冬至洄游必經海域(新竹外海)的烏魚則為另一族群。而台灣西南海域產卵場所捕獲的烏魚,同時發現沿岸與冬至洄游的烏魚基因型。此結果指出,台灣西南海域可能同為沿岸與冬至洄游烏魚的產卵場,且兩個族群的產卵時間都在冬至前後。其次,為建立世界各海域烏魚單倍基因型親源關係樹,由Genbank取得大西洋西岸與夏威夷海域的烏魚控制區基因型共計100種,篩選出親源關係最遠的28種,合併台灣的4種,以淨核?酸替代數目作為遺傳距離,利用neighbor-joining方法建構全球烏魚單倍基因型親緣關係樹。結果顯示,已知烏魚在親緣關係上可分為大西洋與太平洋兩大支系。其中,太平洋支系內夏威夷與台灣海域的烏魚可明顯區分,而台灣海域亦可分為沿岸與冬季洄游兩個不同族群。近年來台灣烏魚的年漁獲量急速下降,本研究結果,可藉以釐清減產的烏魚究為沿岸抑或冬至洄游的族群,將有助於台灣烏魚資源的管理與評估。此外,針對烏魚苗放流,本研究所建訂之生化標籤可協助確定其基因型,以避免人工放流對原有生態之影響。而且冬至洄游烏魚基因型之確立,將有助於其棲息地與洄游路徑之研究。 |
URI: | http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/75138 |
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顯示於系所單位: | 動物學研究所 |
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