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  1. NTU Theses and Dissertations Repository
  2. 醫學院
  3. 微生物學科所
Please use this identifier to cite or link to this item: http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/64326
Title: (一)利用試管中切割系統篩選MALT1之抑制劑
(二)利用酵母菌尋找MALT1之新功能
(I)In vitro cleavage assay for screening of MALT1 inhibitors
(II)Investigation on MALT1 functions in Saccharomyces cerevisiae
Authors: Yi-Han How
侯以涵
Advisor: 董馨蓮(Shin-Lian Doong)
Keyword: CBM複合體,MALT1,蛋白&#37238,抑制劑,酵母菌,YCA1,
CBM complex,MALT1,protease inhibitor,yeast,YCA1,
Publication Year : 2012
Degree: 碩士
Abstract: CBM複合體(CARMA1-BCL10-MALT1)參與在NF-κB活化訊息傳遞中。其中MALT1除了做為鷹架(scaffold)的功能外,也是paracaspase蛋白酶。此外有研究指出ABC-DLBCL淋巴瘤之存活和增生是極度依賴 MALT1的切割活性,所以抑制MALT1活性可作為治療的標靶。本論文第一部分的實驗目的為利用先前實驗室建立的試管中MALT1受質切割系統,來尋找MALT1的活性抑制劑。
首先利用細菌表現並純化His-tag MALT1及BCL10,在系統中確認MALT1可以切割BCL10,而catalytic diad (H415-C464)突變則失去切割活性。另外使用Ac-LRSR-AMC螢光胜肽當做受質,以切割後的發射螢光值來計算MALT1切割活性。在這個系統中, z-VRPR-fmk(已報導的MALT1抑制劑)對MALT1之IC50約12 nM,但z-VAD-fmk (caspase抑制劑) IC50約2 μM。而zVRPR-fmk也能對trypsin造成抑制,且IC50與對MALT1相當(約16 nM)。接著對65個化學物進行篩選,以抑制50%活性為初步門檻,篩選出三個候選藥物IC50約為20 ng/μl。
未來可繼續利用此in vitro系統大量篩選抑制劑,並進一步在in vivo系統中如ABC-DLBCL細胞株進行抑制試驗。
本論文第二部份利用酵母菌來探討MALT1是否具有與YCA1相似的功能。出芽酵母菌具有與人類唯一的paracaspase MALT1序列相似的metacaspase YCA1,已被發現會參與在酵母菌的死亡機制中,也發現能扮演清除細胞內protein aggregates的角色。
首先在H2O2或緩慢加熱刺激後,可觀察到BY4742 Δyca1突變株比野生種的生存率高。然而大量表現YCA1的Δyca1突變株在H2O2處理後生存率卻無降低。將野生種之YCA1 caspase-like domain (CLD)取代為MALT1的CLD對耐受性也無影響。另外,以不同selection marker製備的Δyca1突變株皆不具有比野生種高的耐受性。而BY4741背景之酵母菌也無法證實YCA1參與在酵母菌的死亡機制。
此外BY4742及BY4741背景的Δyca1突變株也觀察不到過去文獻指出的multi-vacuole細胞所佔比例高於野生種2.5倍的現象,starvation刺激後也無法區分差異。因此本部份由於無法重覆YCA1之功能,而無法更進一步探討MALT1。
URI: http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/64326
Fulltext Rights: 有償授權
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