請用此 Handle URI 來引用此文件:
http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/27047
標題: | 從草蝦基因體庫篩選Toll基因 Searching for innate immunity related Toll genes from tiger shrimp (Penaeus monodon) using a genomic platform |
作者: | Chih-Yun Shao 邵芷筠 |
指導教授: | 于宏燦 |
關鍵字: | Toll基因,草蝦,先天性免疫, Toll genes,tiger shrimp,innate immunity, |
出版年 : | 2008 |
學位: | 碩士 |
摘要: | 草蝦為海洋生物,其所生活的環境中,有著難以數計的微生物,經長期的演化過程,已與某些微生物物種之間,發展出互利共生的關係;相反的,某些微生物物種對草蝦而言,則具有感染力與致病性。因此,辨別出對自身有益或是有害的微生物,非常重要,而此機制,主要仰賴於個體的先天性免疫能力〈innate immunity〉,其間所涉及不同的訊息傳遞機制,與相關基因的表現與調控,成為備受關注的研究方向。
就無脊椎生物而言,先天性免疫反應包括兩條主要的訊息傳遞過程:Toll pathway與Imd pathway。兩條反應途徑可以分別針對真菌、革蘭氏陽性菌或革蘭氏陰性菌等外來微生物病原,啟動不同訊息分子的傳遞,從而促進相對應的antimicrobial peptides 〈AMPs〉大量生成,並釋放至組織以破壞入侵病原。先天性免疫機制的重要性不言可喻,所以相關的基因,即使在長久的演化時間下,不論哺乳動物、昆蟲乃至植物中,仍可觀察到高度的保守性,如Toll/Toll-like receptor基因。 本研究即針對Toll基因中較為保守的區段:Toll/Interleukin-1 receptor 〈TIR〉 domanin,設計專一的引子對,進行PCR screening,利用4-step PCR screening的策略,就草蝦fosmid基因體庫進行研究,以期篩選出包含有Toll基因的菌株。 由目前所得的positive clones個數與比例,可推估草蝦基因體中的Toll基因份數約為4.86份,且與已知的草蝦、白蝦及班節蝦的序列比對,相似度分別為62.3%、60.5%與49.2%。並且,確認其基因結構至少包含三個exons與兩個introns。更深入的細節尚待篩選到含有Toll基因的菌株並定序才能得知。 本論文另分析了一個全長完整定序的菌株,總共得14條contig序列,全長將近50 kb,經預測包含有7.5個open reading frames,平均基因密度為151 genes/Mb。推測此菌株中的草蝦序列基因密度較高,約為人類的十倍。 |
URI: | http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/27047 |
全文授權: | 有償授權 |
顯示於系所單位: | 動物學研究所 |
文件中的檔案:
檔案 | 大小 | 格式 | |
---|---|---|---|
ntu-97-1.pdf 目前未授權公開取用 | 681.99 kB | Adobe PDF |
系統中的文件,除了特別指名其著作權條款之外,均受到著作權保護,並且保留所有的權利。