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http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/76392
標題: | 台灣地區小家鼠粒線體DNA控制區序列變異及族群遺傳之研究 Variation of the mtDNA Control Region and Population Genetics of the House Mice (Mus musculus) in Taiwan |
作者: | Shang-Ta Yang 楊尚達 |
出版年 : | 1998 |
學位: | 碩士 |
摘要: | 小家鼠(Mus musculus)為廣佈於世界各地的小型鼠類。在台灣主要分佈在人類活動的環境中;尤其是各地農會的穀倉,往往有小家鼠族群棲於其中。本研究即以小家鼠粒線體DNA控制區為遺傳標記,以定序和PCR-SSCP的方法進行研究;一方面評估SSCP分析法在族群遺傳應用上的可行性,另一方面以所得序列資料推估台灣各穀倉小家鼠族群的遺傳結構,同時探究台灣小家鼠的分類地位、可能起源與演化歷史等問題。 在台灣小家鼠控制區序列上,研究中共發現有13種單倍基因型(haplotype),其中除預期中的M. m. castaneus亞種外,尚發現有M. m. domesticus的控制區基因型存在;此外,有四種M. m. castaneus基因型在控制區內含有76個鹼基為單位的反覆重複片段,因此造成基因型彼此間有長度多型性。定序結果亦顯示,控制區5'端的高度變異區,在區分不同的基因型上,便提供了足夠的訊息。 以控制區5'端高度變異區內片段序列,進行SSCP以及PCR-RFLP分析。綜合兩法後,在13種基因型中,有10種基因型可準確彼此區分。利用定序資料,加上SSCP以及PCR-RFLP分析的結果,我們檢測出29個採樣族群(n=367)中控制區基因型的分佈。其中18個族群,在族群內僅具單一基因型;顯示小家鼠族群可能受到開拓者效應(founder effect)或瓶頸效應(bottleneck effect)所影響。以採樣族群的角度來看時,部份鄰近族群有遺傳組成相異的高度分化現象,顯示其間基因交流可能受阻;但將本島族群歸併成東北、西北、中部、西南以及東部五個地理區域時,鄰近地理區域間分化程度則仍較不鄰近區域間低。考慮中央山脈隔離效應後計算區域間地理距離,則發現區域間遺傳距離與地理距離間,有顯著的正相關,符合isolation by distance模式。 由ΦST值以及族群的親緣關係樹均可發現,金門地區與台灣東南部以外的各地理區域之間,分化程度不高;推測兩地族群可能來源相同,均源自大陸地區。相對而言,本島東南部(花蓮、台東族群)則與其他地區有較高的分化程度;這顯示中央山脈對小家鼠基因交流的隔絕有相當的影響;另外由基因型組成推測,東南族群的小家鼠,其來源、拓殖歷史可能都與其他區域族群相異。 |
URI: | http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/76392 |
全文授權: | 未授權 |
顯示於系所單位: | 動物學研究所 |
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