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  1. NTU Theses and Dissertations Repository
  2. 生命科學院
  3. 生化科技學系
請用此 Handle URI 來引用此文件: http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/37395
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DC 欄位值語言
dc.contributor.advisor楊健志
dc.contributor.authorYu-Jou Luen
dc.contributor.author陸羽柔zh_TW
dc.date.accessioned2021-06-13T15:26:41Z-
dc.date.available2014-08-17
dc.date.copyright2011-08-17
dc.date.issued2011
dc.date.submitted2011-08-11
dc.identifier.urihttp://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/37395-
dc.description.abstract阿拉伯芥 HHP1 (heptahelical transmembrane protein 1) 蛋白質是黃體激素之膜上接受體 mPR (membrane progestin receptor) 的同源蛋白質,具有7個穿膜區塊。目前認為HHP1在阿拉伯芥Abscisic acid (ABA) 與滲透壓訊息調控路徑中做為負調控因子,並可能連結低溫及滲透壓逆境間的訊息傳遞。進行序列分析後發現有許多與ABA、乾旱、高鹽與低溫逆境相關之可能的轉錄調控序列散佈於 HHP1的上游序列 (5’ UTR + -1 ~ -1552 bp) 中。
本研究希望藉由Dual-Luciferase Reporter○R (DLRTM ) Assay System了解這些與逆境相關的序列是否參與HHP1的轉錄調控。建構帶有四種不同長度 HHP1上游序列且具有firefly luciferase報導基因 (FLUC) 之pSP-luc+NF Fusion vector重組載體 (U1 ~ U4-pSP,U1:5’ UTR + -1 ~ -1552 bp;U2:5’ UTR + -1 ~ -1103 bp;U3:5’ UTR + -1 ~ -740 bp 與 U4:5’ UTR + -1 ~ -302 bp) 後,與做為內部對照組可表現 Renilla luciferase報導基因 (RLUC) 的35S-pRL共轉形至阿拉伯芥原生質體中短暫表現,觀察不同長度 HHP1上游序列經正規化 (FLUC/RLUC) 的相對冷光值,並分析這些啟動子片段驅動能力的變化。
由於純化出之原生質體健康程度與載體轉形過程對 DLRTM Assay System的實驗結果影響很大,本研究對原生質體之純化與短暫表現系統,進行部分修改後發現:純化5-7週大植株之真葉獲得之原生質體,使用2 × 106 cells/MMG solution之濃度,並以100:1之 U1 ~ U4-pSP與35S-pRL質量比進行轉形,可有效提高轉形效率並得到最佳的相對冷光值。使用上述之系統並配合 DLRTM Assay System,經過三重複以上之實驗,發現HHP1上游序列越短,其驅動FLUC之能力越強 (驅動能力 U4 > U3 > U2 >U1)。
此外本研究也對原生質體進行外加ABA處理,發現於該系統中,不同長度HHP1上游片段之驅動能力受ABA影響,似乎有提升之現象。
zh_TW
dc.description.abstractHHP1 (heptahelical transmembrane protein 1), a protein with a predicted seven transmembrane domain structure homologous to mPRs (membrane progestin receptors), is determined to be a novel negative regulator in ABA and osmotic signaling. Sequence analysis showed that the fragment upstream to the coding region of HHP1 (5’ UTR + -1 ~ -1552 bp) contains many ABA-, dehydration-, salinity- and low temperature-responsive elements.
In this study, we tried to investigate the stress-responsive elements which are involved in HHP1 transcriptional regulation using Dual-Luciferase Reporter○R (DLRTM ) Assay System (Promega). Four different DNA fragments containing various length of the putative promoter region of HHP1 (U1, 5’ UTR + -1 ~ -1552 bp; U2, 5’ UTR + -1 ~ -1103 bp; U3, 5’ UTR + -1 ~ -740 bp and U4, 5’ UTR + -1 ~ -302 bp) were cloned into vectors harboring firefly luciferase (FLUC). These constructs (U1 ~ U4-pSP) were co-transfected into protoplasts isolated from Arabidopsis mesophyll with internal control plasmid 35S-pRL expressing Renilla luciferase (RLUC). Due to the methods used to isolate and transfect plasmid into protoplasts greatly affected the assay, a few modification were made to optimize the protoplasts isolation and transfection. Protoplasts isolated from 5 ~ 7 week-old Arabidopsis, 2 × 106 cells/MMG solution for transfection, and 100:1 mass ratio of U1 ~ U4-pSP to 35S-pRL gave the best transformation and normalized luciferase expression (FLUC/RLUC). From more than three independent experiments, higher luciferase expressions were observed in the U4-pSP construct which contains the shorter HHP1 upstream fragment.
The experiments were also performed when the protoplasts were treated with abscisic acid. A few interesting preliminary results were discussed.
en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2021-06-13T15:26:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1
ntu-100-R98b47201-1.pdf: 3244172 bytes, checksum: aa5901a3cc2b0f67b62d1b0a6972819d (MD5)
Previous issue date: 2011
en
dc.description.tableofcontents目錄
摘要……………………………………………………………………………………I
Abstract……………………………………………………………………II
縮寫表……………………………………………………………………………III
第一章 緒論…………………………………………………………………………1
1.1 真核生物與植物之核心啟動子………………………………1
1.2 真核生物的轉錄起始機制………………………………………2
1.3 轉錄因子與轉錄調控序列共同調控轉錄進行……3
1.3.1 轉錄因子……………………………………………………………3
1.3.2 轉錄調控序列…………………………………………………………5
1.4 植物非生物性逆境 (abiotic stress) 訊息傳遞過程…………………5
1.5 植物於逆境下之轉錄調控機制………………………………………6
1.6 植物在乾旱、鹽與冷逆境下的轉錄調控網絡……………………………10
1.7 分析轉錄調控機制之方法………………………………………………12
1.7.1 生物資訊分析軟體……………..……………………………………13
1.7.2 報導基因表現系統………………..……………………………13
1.7.2.1 GUS,LUC與GFP …………………………………………14
1.7.2.2 報導基因的表現與偵測正確性受到各種因素影響……………17
1.7.3 報導基因以不同轉形方法進入植物細胞,進行穩定或短暫表現…21
1.8 HHP1 (heptahelical protein 1) ……………………………………………24
1.9 研究動機及重點……………………………………………………………27
第二章 材料與方法………………………………………………………………30
2.1 實驗材料 ……………………………………………………………30
2.1.1 植物材料...…………………………………………………………30
2.1.2 載體……………………………………………………………………30
2.1.3 菌種………………………………………………………………31
2.2 實驗藥品...……………………………………………………………….…32
2.2.1 一般化學藥劑…………………………………………………………32
2.2.2 酵素……………………………………………………………………32
2.2.3 大腸桿菌培養基………………………………………………………32
2.2.4 植物阿拉伯芥培養基1/2 MS….……………………………………..33
2.2.5 阿拉伯芥原生質體之分離與載體轉形使用藥品……………………34
2.2.6 Dual-Luciferase○R Reporter (DLR TM) Assay System使用藥品 (Promega)…………………………………………………………………….36
2.3 儀器設備....………………………………………………………………....37
2.4 實驗方法………………………………………………………………...….38
2.4.1阿拉伯芥種植與生長…………………………………………………38
2.4.1.1 種子表面消毒及低溫處理……………………………………..38
2.4.1.2 無菌培養…………………………………………………….….38
2.4.1.3 土壤培養…………………………………………………….….38
2.4.2 目標載體之建構 (plasmid construction) ….………………………..39
2.4.2.1 以Phusion DNA polymerase進行聚合酶連鎖反應 ………….40
2.4.2.2 PCR產物之分離與純化………………………………………..40
2.4.2.3 DNA之磷酸化反應 …………………………………………...41
2.4.2.4 sticky-end PCR……………….……………………………........41
2.4.2.5 質體DNA小量製備…………………………………………...43
2.4.2.6 DNA限制酶切割反應 ……………………………..………….43
2.4.2.7 DNA之去磷酸化反應………………………………………….44
2.4.2.8 DNA接合反應………………………………………………….44
2.4.2.9 大腸桿菌之轉形…………………………………………….….44
2.4.2.10 菌落檢定………………………………………………………45
2.4.2.11 DNA洋菜膠體電泳…………………………………………...45
2.4.2.12 DNA定量……………………………………………………...46
2.4.3 阿拉伯芥原生質體之分離、轉形及短暫表現………………………46
2.4.3.1 質體DNA中量製備…………………………………………...46
2.4.3.2 阿拉伯芥原生質體之分離……………………………………..47
2.4.3.3 原生質體轉形與短暫表現……………………………………..48
2.4.3.4 估算轉形與短暫培養後之原生質體存活率 (survival rate) …49
2.4.3.5 使用螢光顯微鏡觀察原生質體之轉形效率
(transfection rate) ………………….……………………………………49
2.4.4 Dual-Luciferase○R Reporter (DLR TM) Assay System ……………50
第三章 結果與討論…………………………………………………………………52
3.1 Dual-Luciferase○RReporter (DLR TM) Assay System短暫表現質體之建構.52
3.1.1 U1 ~ U4-pSP與 35S-pSP 短暫表現載體之建構 .…………………53
3.1.2 35S-pRL短暫表現載體之建構………………………………………54
3.2 分析HHP1上游序列可能含有的轉錄調控序列
(cis-regulatory element)………………………………………………………....54
3.3 分析HHP1上游序列中可能具有調控ABA、冷、乾旱或鹽逆境相關
基因表現能力之轉錄調控列…………………………………………………..55
3.4 分析HHP1 上游序列中與ABA、乾旱、鹽或冷逆境基因調控相關之
轉錄調控序列分佈……………………………………………………………..57
3.5 建構阿拉伯芥原生質體之分離、轉形與短暫表現系統…………………58
3.6 在正常生理情況下分析不同長度HHP1上游序列驅動報導基因之能
力………………………………………………………………………………..63
3.7 原生質體之外加荷爾蒙處理……………………………………………...65
3.8 觀察不同長度之HHP1上游序列驅動報導基因之能力是否受ABA影
響……………………………………………………………………….……….66
3.9總結………………….……………………………………………………...67
第四章 未來展望…...………………………………………………………………71
4.1 觀察各長度HHP1上游片段的報導基因驅動能力是否受不同逆境影
響……………………………………………………………………………….71
4.2 觀察由不同生長時期取得之原生質體是否影響各長度HHP1上游片
段的報導基因驅動能力……………………………………………………….72
4.3 尋找並建構可能結合至HHP1上游與逆境或ABA訊息傳遞相關轉
錄調控序列上的轉錄因子…………………………………………………….72
第五章 圖與表……………………………………………………………………...74
附錄…………………………………………………………………………………115
參考文獻…………………………………………………………………………....120
問答集………………………………………………………………………………134
dc.language.isozh-TW
dc.subjectHHP1zh_TW
dc.title利用冷光報導載體系統分析含HHP1啟動子之基因片段zh_TW
dc.titleAnalysis of HHP1 Promoter Using Luciferase Reporter Assay Systemen
dc.typeThesis
dc.date.schoolyear99-2
dc.description.degree碩士
dc.contributor.oralexamcommittee蘇仲卿,常怡雍,張俊哲,陳佩燁
dc.subject.keywordHHP1,zh_TW
dc.relation.page141
dc.rights.note有償授權
dc.date.accepted2011-08-11
dc.contributor.author-college生命科學院zh_TW
dc.contributor.author-dept生化科技學系zh_TW
顯示於系所單位:生化科技學系

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