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出版年	標題	作者	系所
2024	Graph-KIR 在真實資料上的評估及在台灣族群之應用 Evaluation of Graph-KIR on Real Data and its Application to Taiwanese Population	王亭堅; Ting-Jian Wang	生物機電工程學系
2022	使用變分自動編碼器建立單細胞多組學模型的基準測試數據 Data simulation using variational autoencoder to benchmark single-cell multi-omics models	蕭如秀; Ru-Xiu Hsiao	基因體與系統生物學學位學程
2025	再生不良性貧血中的克隆造血和免疫細胞組成分析與其臨床意義 Clonal Hematopoiesis and Immune Cell Composition Analysis in Severe Aplastic Anemia and their Clinical Significances	孫國瑞; Kuo-jui Sun	基因體與系統生物學學位學程
2024	建立臺灣人泛參考基因組提升短序列回貼及KIR分型正確性 Constructing Taiwanese Reference Pangenome (TW-graph) to Improve Read Mapping Rates and KIR typing	邱顯鈞; Hsien-Chun Chiu	生物機電工程學系
2023	應用深度學習於 SNP 微陣列資料預測 HLA 對偶基因型 Applying deep learning on SNP array data to predict HLA alleles	蔡毓璁; Yu-Tsung Tsai	生物機電工程學系
2025	應用生醫文獻大型語言模型於白血病相關基因的擷取與分析 Retrieving Leukemia-related Genes Using Large Language Models built with Biomedical Literature	林東甫; Tung-Pu Lin	生物機電工程學系
2024	構建臺灣人群圖參考基因組應用於HLA等位基因型判讀及評估HLA分型工具在CYP基因分型的表現 Construction of a Taiwanese Population-Specific Graph Reference Genome for HLA Genotyping and Evaluation of HLA Callers in CYP Genotyping	吳冠穎; Guan-Ying Wu	生物機電工程學系
2023	結合機器學習與臨床指引之急性骨髓性白血病風險分層集成模型 An Ensemble Model for Acute Myeloid Leukemia Risk Stratification Recommendations by Combining Machine Learning with Clinical Guidelines	張名翔; Ming-Siang Chang	生物機電工程學系

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