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| DC 欄位 | 值 | 語言 |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | 鄭秋萍(Chiu-Ping Cheng) | |
| dc.contributor.author | Yi-Fan Chen | en |
| dc.contributor.author | 陳羿帆 | zh_TW |
| dc.date.accessioned | 2021-07-10T21:47:09Z | - |
| dc.date.available | 2021-07-10T21:47:09Z | - |
| dc.date.copyright | 2020-02-25 | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.date.submitted | 2020-02-21 | |
| dc.identifier.uri | http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/77113 | - |
| dc.description.abstract | 青枯病菌 (Ralstonia solanacearum, Rs) 所引發之青枯病為極重要土壤傳播性植物細菌病害,常造成全球許多高經濟農作物重大損失。Rs 菌系極為複雜,且屬於phylotype I 之 Rs 菌株在番茄之毒力亦有差異性,然而目前關於 Rs 毒力之分子機制瞭解仍非常有限。本研究室先前發現高毒力 Rs 菌株 Pss190 特有的效應蛋白 Pseudomonas outer protein P 3 (PopP3),在植物中過量表現 popP3 時會壓抑植物之pathogen/microbe-associated molecular patterns (PAMP/MAMP)-triggered immunity (PTI)。本研究旨在進一步探討 PopP3 抑制植物防禦反應之分子調控機制。定序結果發現同為穩定高毒力菌株之 Pss190 與 Pss365 其 PopP3 序列完全相同,支持 PopP3 與 Rs 高毒力之可能相關性。培養基試驗顯示 PopP3 確實可被分泌至 Rs 細胞外,符合微生物效應蛋白特性。PopP3-GFP 會以點狀分佈在圓葉菸草葉細胞質與細胞核中。在穩定抗 Rs 之番茄品系 Hwaii 7996 (H7996) 中表現 PopP3 會減低在 PTI 具關鍵正向調控者功能 之 12g520 的轉錄體量與其調控之 ROS burst,且初步結果指出 12g520 可能與 PopP3 具交互作用。此外,表現 PopP3 會減低誘導 PTI 後之乙烯合成相關標誌基因 ACO1 的轉錄體量。在圓葉菸草表現 PopP3 並透過共免疫沉澱與液相層析串聯二次質譜(Co-IP-LC-MS/MS) 技術篩選 PopP3 之可能互作蛋白質,其中已知參與植物防禦反應之 CALCIUM-SENSING RECEPTOR (CAS) 與已知參與青枯病抗性之SESQUITERPENE SYNTHASE (TPS1) 會提升 PTI 相關之 ROS burst,而同時表現 PopP3 會減低 CAS 或 TPS1 所提升之 ROS 總量,且初步結果指出 CAS 與 TPS1可能與 PopP3 具交互作用。預期這些研究結果將有助於闡明 PopP3 影響植物病害免疫力之具體調控機制。 | zh_TW |
| dc.description.abstract | Ralstonia solanacearum (Rs) is a soil-borne vascular plant pathogen, causing deadly bacteria wilt (BW) and thus serious economic losses on a wide range of crops worldwide. Rs strains are highly complex and phylotype I strains confer varied degrees of virulence/aggressiveness on tomato plants; however, genetic information on pathogen virulence-related factors is still very limited. Our previous studies revealed that a predicted YopJ-type effector protein, Pseudomonas outer protein P 3 (PopP3), is unique to the high-virulence strain Pss190, and PopP3 reduces pathogen/microbe-associated molecular patterns (PAMP/MAMP)-triggered immunity (PTI) in tomato and Nicotiana benthamiana. This study aimed to further elucidate the involved mechanisms. Results of sequencing assay revealed that PopP3 sequences in Pss190 and Pss365 are identical, supporting that PopP3 could be crucial for high-virulence of Rs. Medium secretion assay confirmed that PopP3 is secreted by Rs. When expressed in N. benthamiana leaf, PopP3-GFP forms cytosolic and nuclear foci. Expression of PopP3 in tomato reduces the transcript level of 12g520, a gene with a crucial positive role in tomato PTI, and 12g520-mediated PTI-related ROS burst. Preliminary data further suggested possible interaction between PopP3 and 12g520 protein. Expression of PopP3 also reduced the transcript level of ethylene biosynthesis enzyme ACO1, after triggering PTI. Furthermore, Co-IP-LC-MS/MS was used to search for interacting plant proteins of PopP3 in N. benthamiana. Among the candidate interacting proteins, CALCIUM-SENSING RECEPTOR (CAS) and SESQUITERPENE SYNTHASE 1 (TPS1) play a positive role in PTI-related ROS burst, and expression of PopP3 reduces this effect. Preliminary data further suggested possible interactions between PopP3 and these two proteins. These results are expected to help elucidate the exact mechanism underlying the PopP3’s suppressing effect on plant PTI. | en |
| dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2021-07-10T21:47:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ntu-109-R06b42019-1.pdf: 8932373 bytes, checksum: 9e1d5cc5266ccc9e8a014c686d199cfa (MD5) Previous issue date: 2020 | en |
| dc.description.tableofcontents | 口試委員審定書 I
謝誌 II 中文摘要 III Abstract IV 常用縮寫與全名對照表 V 目錄 VII 圖表目錄 X 附錄目錄 XI 第一章 前言 1 1. 植物病害防禦反應 1 1.1植物PTI 反應 1 1.2植物ETI 反應 2 1.3植物抗病訊息傳遞 2 2. 病原細菌之第三型分泌系統 3 2.1 調控蛋白 3 2.2 構造蛋白 4 2.3 效應蛋白 (T3Es) 4 3. 病原細菌 T3Es 對植物之作用 5 3.1作用於細胞膜之T3Es 5 3.2作用於葉綠體與粒線體之T3Es 5 3.3作用於囊泡運輸之 T3Es 6 3.4 作用於 MAPK 訊息傳遞之T3Es 7 3.5作用於細胞核之T3Es 7 3.6干擾植物賀爾蒙之T3Es 7 4. 青枯病與Rs 8 5. Rs 之致病機制 9 6. Rs 之 T3Es 10 6.1 GALA / RipG 家族 11 6.2 AWR / RipA 家族 11 6.3 AvrA / RipAA 12 6.4 Harpins 12 6.5 YopJ superfamily 13 7. Rs 毒力相關研究 14 8. 前人研究與研究動機 15 第二章 材料與方法 16 1. 植物材料與栽培條件 16 2. 微生物材料與培養條件 16 3. 選殖技術 16 3.1 聚合酶連鎖反應 (polymerase chain reaction, PCR) 16 3.2 DNA 瓊脂糖凝膠電泳 17 3.3 DNA 片段純化 17 3.4 DNA 限制酶消化水解 17 3.5 DNA 片段結合 18 3.6 TOPO® 質體構築 18 3.7 LR 重組互換反應 (LR recombination) 18 3.8 大腸桿菌勝任細胞熱休克轉型作用 19 3.9 電穿孔轉型作用之勝任細胞製備 19 3.10 電穿孔轉型作用 19 3.11 大腸桿菌質體萃取 19 3.12 Rs 染色體 DNA 萃取 20 4. 植物 RNA 萃取 20 5. 反轉錄反應 21 6. 定量聚合酶連鎖反應 (Quantitative PCR) 21 6.1 半定量 PCR (Semi-quantitative PCR, sqPCR) 21 6.2 定量 PCR (Quantitative PCR, qPCR) 22 7. 植物蛋白質檢測 22 7.1 植物蛋白質萃取 22 7.2 蛋白質定量 22 7.3 蛋白質電泳 (SDS-PAGE) 23 7.4 西方墨點法 (Western blot) 23 8. 效應蛋白外泌試驗 (Secretion protein assay) 24 9. 植物體短暫表現蛋白基因 24 9.1 菸草葉部基因短暫表現 24 9.2 病毒誘導短暫性大量表現 (Virus mediated gene overexpression, VOX) 25 10. 蛋白質在菸草葉片細胞之定位分析 25 11. 雙分子螢光互補 (Bimolecular fluorescence complementation, BiFC) 25 11.1 質體構築 25 11.2 BiFC 26 12. 植物 PTI 反應指標檢測 26 12.1 病原菌準備 26 12.2 癒傷葡聚糖堆積分析 26 12.3 ROS 檢測 (ROS Detection Assay) 26 13. 效應蛋白在植物體內之作用蛋白質篩選 28 13.1 免疫沉澱法 (Immunoprecipitation) 28 13.2 高效液相層析串聯質譜儀(LC-MS/MS)分析 28 14. 序列分析與統計分析 28 第三章 結果 29 1. PopP3 相關成員在 Rs 菌系中之分佈 29 2. 在本土高毒力菌株中 popP3 之序列比對 29 3. PopP3 之外泌分析 30 4. PopP3 在植物細胞中之座落位置 30 5. PopP3 對抗病防禦標誌基因表現之影響 30 6. PopP3 對番茄 12g520 與 12g550基因表現之影響 31 7. PopP3 對 12g520 參與之 PTI 反應的影響與兩者之蛋白質交互作用 31 8. 搜尋 PopP3 之可能植物互作蛋白質 32 9. PopP3 對候選互作蛋白質在 PTI 反應之影響 33 10. PopP3 與候選互作蛋白質之蛋白質交互檢測 33 第四章 討論 34 1. PopP3 具 T3E 特性且為 Rs 穩定高毒力之關鍵因子 34 2. PopP3 抑制植物 PTI可能之防禦訊息路徑 35 3. PopP3 對番茄抗青枯病主導 QTL Bwr12 中 12g520基因之影響 36 4. PopP3 對候選互作蛋白質 CAS 之功能影響與交互作用 38 5. PopP3 對候選互作蛋白質 TPS1 之功能影響與交互作用 39 6. BiFC 試驗中 PopP3 與所有實驗組別蛋白質皆可能有交互作用之探討 39 7. 結語 40 參考文獻 42 | |
| dc.language.iso | zh-TW | |
| dc.subject | 效應蛋白 | zh_TW |
| dc.subject | 青枯病菌 | zh_TW |
| dc.subject | PopP3 | zh_TW |
| dc.subject | 毒力 | zh_TW |
| dc.subject | PAMP-triggered immunity | zh_TW |
| dc.subject | effector | en |
| dc.subject | virulence | en |
| dc.subject | PopP3 | en |
| dc.subject | PAMP-triggered immunity | en |
| dc.subject | Ralstonia solanacearum | en |
| dc.title | 青枯病菌效應蛋白 PopP3 抑制植物防禦之機制研究 | zh_TW |
| dc.title | The study on the mechanisms of Ralstonia solanacearum effector PopP3 in suppressing plant immunity | en |
| dc.type | Thesis | |
| dc.date.schoolyear | 108-1 | |
| dc.description.degree | 碩士 | |
| dc.contributor.oralexamcommittee | 林乃君(Nai-Chun Lin),王雅筠(Ya-Yun Wang),楊淑怡(Shu-Yi Yang) | |
| dc.subject.keyword | 青枯病菌,效應蛋白,PopP3,毒力,PAMP-triggered immunity, | zh_TW |
| dc.subject.keyword | Ralstonia solanacearum,effector,PopP3,virulence,PAMP-triggered immunity, | en |
| dc.relation.page | 134 | |
| dc.identifier.doi | 10.6342/NTU202000530 | |
| dc.rights.note | 未授權 | |
| dc.date.accepted | 2020-02-21 | |
| dc.contributor.author-college | 生命科學院 | zh_TW |
| dc.contributor.author-dept | 植物科學研究所 | zh_TW |
| 顯示於系所單位: | 植物科學研究所 | |
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