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出版年	標題	作者	系所
2015	藉由定量磷酸化蛋白質體學分析探討MCM2在肺癌細胞中的調控網絡 Quantitative phosphoproteomic analysis uncovers the regulatory networks of minichromosome maintenance protein 2 in lung cancer cells	Siao-Ting Chong; 張曉婷	分子與細胞生物學研究所
2015	DynaPho: 由磷酸化蛋白質體資料推論動態化生物訊息 DynaPho: inferring signaling dynamics from phosphoproteomics data	Jian-Kai Wang; 王建凱	基因體與系統生物學學位學程
2016	整合定量與磷酸化蛋白體學探討鋅指蛋白ZNF322A在人類肺癌A549細胞中所扮演的調控角色 Integrative Quantitative Proteomics and Phosphoproteomics Reveal the Regulatory Role of ZNF322A in Lung Cancer A549 Cells	Tsai-Yu Lin; 林采羭	生命科學系
2018	以基因表現策略探討驅蟲藥Niclosamide於高危險性神經母細胞瘤之治療效果 A Gene Expression-based Strategy Identifies the Anthelminthic Drug Niclosamide for High-risk Neuroblastoma Therapy	Wen-Chi Lee; 李文琦	分子與細胞生物學研究所
2011	大腸桿菌的外源性正丁醇逆境之全基因組分析 Genome-wide analysis of exogenous 1-butanol stress in Escherichia coli	Hsuan-Kai Wang; 王宣凱	分子與細胞生物學研究所
2010	探討人工微型核醣核酸p-27-5p於乳癌細胞株T-47D基因調控網路之影響 Gene Regulatory Networks of Artificial MicroRNA p-27-5p-Treated Human Breast Cancer Cell Line T-47D	Chung-Cheng Hsu; 許仲誠	分子與細胞生物學研究所
2010	紫色非硫光合菌之磷酸化蛋白質體學研究 Phosphoproteome of Rhodopseudomonas palustris	Tsun-Hsuan Yi; 尹存瑄	分子與細胞生物學研究所
2009	新miRNA P-27-5p影響人類癌細胞週期及其分子機轉之探討 Effects of a Novel miRNA P-27-5p on Human Cancer Cell Cycle and the Related Molecular Mechanism	Ya-Ya Chang; 張雅雅	分子與細胞生物學研究所
2007	探討TPA誘導HL-60細胞分化的基因表現與微型核醣核酸之關係 Relationship between Gene Expression and microRNA in TPA-Induced HL-60 Cell Differentiation	Kuo-Chin Ni; 倪國欽	分子與細胞生物學研究所
2008	光合菌於各種代謝環境下之系統生物學研究 Systems Analysis of Rhodopseudomonas palustris in Different Metabolic States	Ting-Yuan Chen; 陳定遠	分子與細胞生物學研究所