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http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/66316Full metadata record
| ???org.dspace.app.webui.jsptag.ItemTag.dcfield??? | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | 張麗冠(Li-Kwan Chang) | |
| dc.contributor.author | Hsiang-Hung Huang | en |
| dc.contributor.author | 黃翔弘 | zh_TW |
| dc.date.accessioned | 2021-06-17T00:30:02Z | - |
| dc.date.available | 2025-02-18 | |
| dc.date.copyright | 2020-02-18 | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.date.submitted | 2020-02-10 | |
| dc.identifier.uri | http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/66316 | - |
| dc.description.abstract | EB病毒(Epstein-Barr virus)為人類最早發現的致癌病毒,具有潛伏期(latent)與溶裂期(lytic)兩種生活史。溶裂期所表現的Rta蛋白質具有活化病毒基因的能力,另外亦能與病毒複製複合體結合,進而協助病毒基因複製。Rta的多功能使之成為EB病毒要產生具有感染力病毒顆粒時最重要的蛋白質之一。透過電子顯微鏡的觀察,本研究發現在病毒生活史晚期,Rta與病毒殼體結合於細胞核內,因此推測Rta在晚期可能具有活化病毒基因以外的能力。在蔗糖梯度的分析中,Rta與釋放的病毒顆粒分布於相同的蔗糖梯度,進一步使用trypsin digestion與de-tegument assay分析出Rta的性質與tegument protein相同,證實Rta為tegument protein。在GST pulldown與免疫沉澱的實驗中發現Rta與殼體蛋白質VCA、BDLF1、BORF1與BFRF3會直接結合,並於後續的螢光顯微鏡分析中發現Rta與BORF1、BFRF3在溶裂期時會重合於細胞核內,顯示Rta為在細胞核內與殼體結合的inner tegument protein。接著,本研究發現殼體蛋白質BORF1的穩定性會受到泛素化修飾(ubiquitination)的調控,而Rta能夠去除BORF1的泛素化修飾,進而穩定BORF1。此為第一個發現Rta與晚期蛋白質的關聯,並證明Rta為tegument protein的研究。此發現顯示Rta在EB病毒生活史晚期與感染時可能具有新的角色,可以更進一步了解EB病毒生活史的發展。 | zh_TW |
| dc.description.abstract | Epstein-Barr virus is the first identified human oncovirus with the latent and lytic life cycles. Lytic protein Rta activates viral genes and assists viral genome replication by interacting with viral replicating complex. Multifunction of Rta made it one of the most critical protein when EBV is producing infectious virus particles. In an immunogold blot¬ting analysis, we found that Rta associates with virus particles in the nucleus at the late stage of the lytic cycle, demonstrating Rta is more than a transcription and replication activator. Rta also cosediments with EBV virions, and shows similar properties as the EBV tegument protein in trypsin digestion and de-tegument assay, indicating that Rta is a tegument protein. Glutathione S-transferase (GST)-pulldown assay and immunoprecip¬ita¬tion also showed that Rta interacts directly with EBV capsid proteins, including VCA, BDLF1, BFRF3, and BORF1. In an immunofluorescence analysis, Rta colocalizes with BORF1 and BFRF3 in the nucleus during lytic progression, revealing that Rta is an inner tegument protein. Additionally, this study found that BORF1’s ubiquitination regulates its stability, and Rta can reduce the levels of BORF1’s ubiquitination, thus increasing the stability of BORF1. In conclusion, this study finds that Rta is a tegument protein that may improve EBV capsid stability and critical to capsid assembly. | en |
| dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2021-06-17T00:30:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ntu-109-D01b22001-1.pdf: 4533077 bytes, checksum: 7f96d285bf379d0d2f207581e119d2a2 (MD5) Previous issue date: 2020 | en |
| dc.description.tableofcontents | 中文摘要 ii
Abstract iii 縮寫表 v 第一章、緒論 1 1.1 疱疹病毒(Herpesvirus)的結構、組裝與釋放 1 1.2 疱疹病毒(Herpesvirus)的tegument protein 3 1.3 EB病毒 (Epstain-Barr virus) 4 1.4 EB病毒的感染 4 1.5 EB病毒生活史 5 1.6 EB病毒的結構與組裝 7 1.7 EB病毒的釋放與Tegument proteins的功能 8 1.8 Rta 9 1.9 受Rta調控的EB病毒基因 10 1.10 泛素化修飾與去泛素化修飾(ubiquitination and deubiquitination) 11 1.11 Rta的轉譯後修飾(post-translational modification) 13 1.12 EB病毒殼體蛋白質的轉譯後修飾 13 1.13 研究目的與重要性 14 第二章、材料與方法 15 2.1 菌種與細胞株(Bacteria strain and cell lines) 15 2.2 質體 16 2.3 質體萃取與大腸桿菌轉型作用 16 2.4 西方墨點法(Western blot) 17 2.5 EB病毒顆粒沉澱與蔗糖梯度離心純化 17 2.6 De-tegument assay 19 2.7 Trypsin digestion assay 19 2.8 免疫螢光分析(Immunofluorescence analysis) 20 2.9 電子顯微鏡分析 21 2.10 免疫金粒子標定(Immuno gold labeling) 22 2.11 Glutathione S-Transferase (GST) pulldown 23 2.12 細胞轉染(transfection) 24 2.13 免疫沉澱法(Immunoprecipitation) 24 2.14 胞外去泛素酶活性分析 25 2.15 Lentivirus細胞株建立 26 2.16 蛋白質穩定性測試 26 第三章、結果 27 3.1 Rta與細胞核的病毒殼體結合 27 3.2 Rta為病毒顆粒的組成分 27 3.3 Rta為tegument protein 28 3.4 Rta與殼體蛋白質結合 29 3.5 Rta與殼體蛋白質BORF1及BFRF3在病毒溶裂期與細胞核內重合 30 3.6 Rta調控BORF1的泛素化修飾並增加其穩定性 31 3.7 Rta不具去泛素酶活性 32 3.8 Rta的N端與HA-BORF1對BORF1的泛素化修飾的影響 32 3.9 Rta與USP11具有穩定BORF1的能力 33 3.10 Rta、BORF1與USP11的結合 35 第四章、討論 37 4.1 Rta為tegument protein並穩定BORF1 37 4.2 Rta去泛素機制的探討 38 4.3 Rta對殼體組裝的影響 43 4.4 Rta在病毒晚期可能具有的角色 44 4.4.1 Rta與Tegumentation 44 4.4.2 Rta與Primary envelopment 45 4.4.3 Rta與Secondary envelopment 45 4.4.4 Rta與Infection 46 4.5 殼體蛋白質對Rta活性的影響 47 4.6 USP11、PML-NBs與BORF1的核內分布 47 第五章、圖表 49 表一、Rta免疫金粒子相對標定係數(Relative labeling index) 49 圖一、Rta與病毒殼體結合 50 圖二、Rta與組裝後的病毒殼體結合 51 圖三、病毒顆粒蔗糖梯度分析 52 圖四、Rta為EB病毒的tegument protein 54 圖五、Rta與EB病毒殼體蛋白質結合 55 圖六、Rta與殼體蛋白質BORF1、BFRF3的螢光顯微鏡分析 57 圖七、Rta調控BORF1的泛素化修飾並穩定其蛋白質 59 圖八、Rta胞外去泛素酶活性分析 61 圖九、Rta的N端對BORF1泛素化修飾的影響 64 圖十、Rta與USP11調控BORF1的泛素化修飾與穩定性 66 圖十一、Rta、BORF1與Rta的交互作用 67 第六章、參考資料 69 第七章、附錄 105 附錄一、HSV-1 病毒顆粒CryoEM構造(Huet et al. 2016) 105 附錄二、HSV-1病毒殼體(Sae-Ueng et al. 2014) 106 附錄三、HSV-1病毒顆粒釋放路徑(Johnson and Baines 2011) 107 附錄四、EB病毒生活史 108 附錄五、EB病毒顆粒與KSHV的CryoEM構造(Germi et al. 2012) 109 附錄六、GFP-BORF1與HA-BORF1在細胞內的分布 110 附錄七、本研究所使用之抗體表 111 附錄八、本研究所使用之質體表 114 發表著作 118 | |
| dc.language.iso | zh-TW | |
| dc.subject | 蛋白質穩定性 | zh_TW |
| dc.subject | EB病毒 | zh_TW |
| dc.subject | 蛋白質穩定性 | zh_TW |
| dc.subject | BORF1 | zh_TW |
| dc.subject | Tegument proteins | zh_TW |
| dc.subject | EB病毒 | zh_TW |
| dc.subject | Rta | zh_TW |
| dc.subject | Rta | zh_TW |
| dc.subject | BORF1 | zh_TW |
| dc.subject | Tegument proteins | zh_TW |
| dc.subject | BORF1 | en |
| dc.subject | protein stability | en |
| dc.subject | BORF1 | en |
| dc.subject | Tegument proteins | en |
| dc.subject | Rta | en |
| dc.subject | Epstein-barr virus | en |
| dc.subject | Rta | en |
| dc.subject | Tegument proteins | en |
| dc.subject | protein stability | en |
| dc.subject | Epstein-barr virus | en |
| dc.title | Rta蛋白質在Epstein-Barr virus晚期生活史所扮演的角色 | zh_TW |
| dc.title | Role of Rta in the late stage of Epstein-Barr virus life cycle | en |
| dc.type | Thesis | |
| dc.date.schoolyear | 108-1 | |
| dc.description.degree | 博士 | |
| dc.contributor.oralexamcommittee | 劉世東(Shih-Tung Liu),張沛鈞(Pey-Jium Chang),廖憶純(Yi-Chun Liao),羅凱尹(Kai-Yin Lo) | |
| dc.subject.keyword | EB病毒,Rta,Tegument proteins,BORF1,蛋白質穩定性, | zh_TW |
| dc.subject.keyword | Epstein-barr virus,Rta,Tegument proteins,BORF1,protein stability, | en |
| dc.relation.page | 118 | |
| dc.identifier.doi | 10.6342/NTU202000380 | |
| dc.rights.note | 有償授權 | |
| dc.date.accepted | 2020-02-10 | |
| dc.contributor.author-college | 生命科學院 | zh_TW |
| dc.contributor.author-dept | 生化科技學系 | zh_TW |
| Appears in Collections: | 生化科技學系 | |
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