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  1. NTU Theses and Dissertations Repository
  2. 生命科學院
  3. 生化科技學系
Please use this identifier to cite or link to this item: http://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/66316
Full metadata record
???org.dspace.app.webui.jsptag.ItemTag.dcfield???ValueLanguage
dc.contributor.advisor張麗冠(Li-Kwan Chang)
dc.contributor.authorHsiang-Hung Huangen
dc.contributor.author黃翔弘zh_TW
dc.date.accessioned2021-06-17T00:30:02Z-
dc.date.available2025-02-18
dc.date.copyright2020-02-18
dc.date.issued2020
dc.date.submitted2020-02-10
dc.identifier.urihttp://tdr.lib.ntu.edu.tw/jspui/handle/123456789/66316-
dc.description.abstractEB病毒(Epstein-Barr virus)為人類最早發現的致癌病毒,具有潛伏期(latent)與溶裂期(lytic)兩種生活史。溶裂期所表現的Rta蛋白質具有活化病毒基因的能力,另外亦能與病毒複製複合體結合,進而協助病毒基因複製。Rta的多功能使之成為EB病毒要產生具有感染力病毒顆粒時最重要的蛋白質之一。透過電子顯微鏡的觀察,本研究發現在病毒生活史晚期,Rta與病毒殼體結合於細胞核內,因此推測Rta在晚期可能具有活化病毒基因以外的能力。在蔗糖梯度的分析中,Rta與釋放的病毒顆粒分布於相同的蔗糖梯度,進一步使用trypsin digestion與de-tegument assay分析出Rta的性質與tegument protein相同,證實Rta為tegument protein。在GST pulldown與免疫沉澱的實驗中發現Rta與殼體蛋白質VCA、BDLF1、BORF1與BFRF3會直接結合,並於後續的螢光顯微鏡分析中發現Rta與BORF1、BFRF3在溶裂期時會重合於細胞核內,顯示Rta為在細胞核內與殼體結合的inner tegument protein。接著,本研究發現殼體蛋白質BORF1的穩定性會受到泛素化修飾(ubiquitination)的調控,而Rta能夠去除BORF1的泛素化修飾,進而穩定BORF1。此為第一個發現Rta與晚期蛋白質的關聯,並證明Rta為tegument protein的研究。此發現顯示Rta在EB病毒生活史晚期與感染時可能具有新的角色,可以更進一步了解EB病毒生活史的發展。zh_TW
dc.description.abstractEpstein-Barr virus is the first identified human oncovirus with the latent and lytic life cycles. Lytic protein Rta activates viral genes and assists viral genome replication by interacting with viral replicating complex. Multifunction of Rta made it one of the most critical protein when EBV is producing infectious virus particles. In an immunogold blot¬ting analysis, we found that Rta associates with virus particles in the nucleus at the late stage of the lytic cycle, demonstrating Rta is more than a transcription and replication activator. Rta also cosediments with EBV virions, and shows similar properties as the EBV tegument protein in trypsin digestion and de-tegument assay, indicating that Rta is a tegument protein. Glutathione S-transferase (GST)-pulldown assay and immunoprecip¬ita¬tion also showed that Rta interacts directly with EBV capsid proteins, including VCA, BDLF1, BFRF3, and BORF1. In an immunofluorescence analysis, Rta colocalizes with BORF1 and BFRF3 in the nucleus during lytic progression, revealing that Rta is an inner tegument protein. Additionally, this study found that BORF1’s ubiquitination regulates its stability, and Rta can reduce the levels of BORF1’s ubiquitination, thus increasing the stability of BORF1. In conclusion, this study finds that Rta is a tegument protein that may improve EBV capsid stability and critical to capsid assembly.en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2021-06-17T00:30:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1
ntu-109-D01b22001-1.pdf: 4533077 bytes, checksum: 7f96d285bf379d0d2f207581e119d2a2 (MD5)
Previous issue date: 2020
en
dc.description.tableofcontents中文摘要 ii
Abstract iii
縮寫表 v
第一章、緒論 1
1.1 疱疹病毒(Herpesvirus)的結構、組裝與釋放 1
1.2 疱疹病毒(Herpesvirus)的tegument protein 3
1.3 EB病毒 (Epstain-Barr virus) 4
1.4 EB病毒的感染 4
1.5 EB病毒生活史 5
1.6 EB病毒的結構與組裝 7
1.7 EB病毒的釋放與Tegument proteins的功能 8
1.8 Rta 9
1.9 受Rta調控的EB病毒基因 10
1.10 泛素化修飾與去泛素化修飾(ubiquitination and deubiquitination) 11
1.11 Rta的轉譯後修飾(post-translational modification) 13
1.12 EB病毒殼體蛋白質的轉譯後修飾 13
1.13 研究目的與重要性 14
第二章、材料與方法 15
2.1 菌種與細胞株(Bacteria strain and cell lines) 15
2.2 質體 16
2.3 質體萃取與大腸桿菌轉型作用 16
2.4 西方墨點法(Western blot) 17
2.5 EB病毒顆粒沉澱與蔗糖梯度離心純化 17
2.6 De-tegument assay 19
2.7 Trypsin digestion assay 19
2.8 免疫螢光分析(Immunofluorescence analysis) 20
2.9 電子顯微鏡分析 21
2.10 免疫金粒子標定(Immuno gold labeling) 22
2.11 Glutathione S-Transferase (GST) pulldown 23
2.12 細胞轉染(transfection) 24
2.13 免疫沉澱法(Immunoprecipitation) 24
2.14 胞外去泛素酶活性分析 25
2.15 Lentivirus細胞株建立 26
2.16 蛋白質穩定性測試 26
第三章、結果 27
3.1 Rta與細胞核的病毒殼體結合 27
3.2 Rta為病毒顆粒的組成分 27
3.3 Rta為tegument protein 28
3.4 Rta與殼體蛋白質結合 29
3.5 Rta與殼體蛋白質BORF1及BFRF3在病毒溶裂期與細胞核內重合 30
3.6 Rta調控BORF1的泛素化修飾並增加其穩定性 31
3.7 Rta不具去泛素酶活性 32
3.8 Rta的N端與HA-BORF1對BORF1的泛素化修飾的影響 32
3.9 Rta與USP11具有穩定BORF1的能力 33
3.10 Rta、BORF1與USP11的結合 35
第四章、討論 37
4.1 Rta為tegument protein並穩定BORF1 37
4.2 Rta去泛素機制的探討 38
4.3 Rta對殼體組裝的影響 43
4.4 Rta在病毒晚期可能具有的角色 44
4.4.1 Rta與Tegumentation 44
4.4.2 Rta與Primary envelopment 45
4.4.3 Rta與Secondary envelopment 45
4.4.4 Rta與Infection 46
4.5 殼體蛋白質對Rta活性的影響 47
4.6 USP11、PML-NBs與BORF1的核內分布 47
第五章、圖表 49
表一、Rta免疫金粒子相對標定係數(Relative labeling index) 49
圖一、Rta與病毒殼體結合 50
圖二、Rta與組裝後的病毒殼體結合 51
圖三、病毒顆粒蔗糖梯度分析 52
圖四、Rta為EB病毒的tegument protein 54
圖五、Rta與EB病毒殼體蛋白質結合 55
圖六、Rta與殼體蛋白質BORF1、BFRF3的螢光顯微鏡分析 57
圖七、Rta調控BORF1的泛素化修飾並穩定其蛋白質 59
圖八、Rta胞外去泛素酶活性分析 61
圖九、Rta的N端對BORF1泛素化修飾的影響 64
圖十、Rta與USP11調控BORF1的泛素化修飾與穩定性 66
圖十一、Rta、BORF1與Rta的交互作用 67
第六章、參考資料 69
第七章、附錄 105
附錄一、HSV-1 病毒顆粒CryoEM構造(Huet et al. 2016) 105
附錄二、HSV-1病毒殼體(Sae-Ueng et al. 2014) 106
附錄三、HSV-1病毒顆粒釋放路徑(Johnson and Baines 2011) 107
附錄四、EB病毒生活史 108
附錄五、EB病毒顆粒與KSHV的CryoEM構造(Germi et al. 2012) 109
附錄六、GFP-BORF1與HA-BORF1在細胞內的分布 110
附錄七、本研究所使用之抗體表 111
附錄八、本研究所使用之質體表 114
發表著作 118
dc.language.isozh-TW
dc.subject蛋白質穩定性zh_TW
dc.subjectEB病毒zh_TW
dc.subject蛋白質穩定性zh_TW
dc.subjectBORF1zh_TW
dc.subjectTegument proteinszh_TW
dc.subjectEB病毒zh_TW
dc.subjectRtazh_TW
dc.subjectRtazh_TW
dc.subjectBORF1zh_TW
dc.subjectTegument proteinszh_TW
dc.subjectBORF1en
dc.subjectprotein stabilityen
dc.subjectBORF1en
dc.subjectTegument proteinsen
dc.subjectRtaen
dc.subjectEpstein-barr virusen
dc.subjectRtaen
dc.subjectTegument proteinsen
dc.subjectprotein stabilityen
dc.subjectEpstein-barr virusen
dc.titleRta蛋白質在Epstein-Barr virus晚期生活史所扮演的角色zh_TW
dc.titleRole of Rta in the late stage of Epstein-Barr virus life cycleen
dc.typeThesis
dc.date.schoolyear108-1
dc.description.degree博士
dc.contributor.oralexamcommittee劉世東(Shih-Tung Liu),張沛鈞(Pey-Jium Chang),廖憶純(Yi-Chun Liao),羅凱尹(Kai-Yin Lo)
dc.subject.keywordEB病毒,Rta,Tegument proteins,BORF1,蛋白質穩定性,zh_TW
dc.subject.keywordEpstein-barr virus,Rta,Tegument proteins,BORF1,protein stability,en
dc.relation.page118
dc.identifier.doi10.6342/NTU202000380
dc.rights.note有償授權
dc.date.accepted2020-02-10
dc.contributor.author-college生命科學院zh_TW
dc.contributor.author-dept生化科技學系zh_TW
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