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出版年	標題	作者	系所
2023	以粒線體DNA及雙限制酶切位點標定法探究臺灣小燕鷗的遺傳多樣性及族群結構 Exploring genetic diversity and population structure of the Little Tern (Sternula albifrons) in Taiwan based on mtDNA and ddRAD sequencing data	江美雪; Mei-Shuet Kong	海洋研究所
2025	利用環境DNA高通量複合分子條碼技術以探究臺灣東部及西部外海魚類群聚在空間和季節上之差異 Environmental DNA metabarcoding reveals distinct spatial and seasonal patterns in offshore fish communities in eastern and western Taiwan	王奕鈞; Yi-Chun Wang	海洋研究所
2024	印度-西太平洋棘花鱸屬魚類和近親之多基因親緣關係及分類研究（鱸形目：花鱸科） Multigene phylogeny and taxonomy of the Indo-West Pacific anthias fish genus Plectranthias and their relatives (Perciformes: Anthiadidae)	鄧志毅; Chi-Ngai Tang	海洋研究所
2025	印度─西太平洋地區淺水域魚類之族群基因體與生物地理研究 Population Genomics and Biogeography of Shallow-Water Fishes in the Indo-West Pacific	許凌藍; Ling-Lan Hsu	海洋研究所
2025	比目魚鮃科魚類親緣關係、物種界定及分類修訂（真骨魚類：鰺形亞目） Phylogeny, Species Delimitation and Taxonomic Revision of the Flatfish Family Bothidae (Teleostei: Carangiformes)	董木華; Pakorn Tongboonkua	海洋研究所
2025	重新評估刺尾鯛目的演化歷史：基於時間校準框架探討笛鯛科、龍占魚科以及金線魚科的親緣關係與生態多樣化 Re-evaluating the evolutionary history of Acanthuriformes: phylogenetic relationships and ecological diversification in Lutjanidae, Lethrinidae, and Nemipteridae within a time-calibrated framework	劉力瑄; Li-Hsuan Liu	海洋研究所
2023	鼠尾鱈科魚類（鱈形目：鼠尾鱈科）聚焦於奈氏鱈屬之親緣關係及分類研究 Phylogeny and taxonomy of Grenadiers (Gadiformes: Macrouridae) with a focus on Nezumia species	陳泓維; Hung-Wei Chen	海洋研究所

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